Buscando software para organizar artículos

Hace un par de años me puse a resolver un problema que tengo desde siempre: leo artículos y libros de matemáticas regularmente, y muchas veces me encuentro con que no recuerdo dónde he leído algo que necesito. Por aquel entonces empecé a hacer fichas escritas de los libros que encontraba interesantes. Pero trabajar electrónicamente tiene ventajas importantes desde mi punto de vista (poco espacio físico, portabilidad, etc.) así que hace unos meses decidí montarme una base de datos bibliográfica por ordenador.

¿Qué quiero exactamente? Tener guardados mis artículos en el ordenador (en formato PDF, quizás otros también) y una ficha para cada uno de ellos, donde tenga los detalles habituales (título, autores y tal) y además pueda añadir resúmenes, descripciones, índices, etc. Básicamente, lo que se suele llamar un "document manager".

Para esto podría haber usado un fichero de texto central (o uno por artículo) pero me he dado cuenta de que hay una funcionalidad muy interesante que no puedo dejar pasar: la posibilidad de tener enlaces en el resumen de un artículo a otro. Así que lo que quiero es algo como una wikipedia personal, donde a cada página pueda asociarle un artículo (o más, por qué no).

Hay que decir que pido dos condiciones más: que sea multiplataforma (a veces trabajo en Linux y a veces en Windows) y que sea gratis. Llevo tiempo buscando algún software que haga esto, y las opciones más razonables que he encontrado hasta ahora son:

• La mejor opción es instalarme una wiki personal, como la wikipedia de siempre pero editada sólo por mí. Tiene la ventaja de que ya está toda la infraestructura de páginas enlazables, pero suele hacer falta instalar varias cosas (servidores y tal) porque están pensadas para usarlas online. He probado una llamada MoinMoin, que funciona bien (python+html, muy funcional). Aun así, se me hace pesada la inicialización cada vez que quiero ver o editar algo, y además va un poco lenta a pesar de estar casi vacía. Por eso espero encontrar algo todavía mejor.


• Rana se ha ofrecido a programarme algo con las funciones que yo quiero, para poner a prueba un poco sus habilidades de programadora. Sería una base de datos con formularios, o algo parecido. La base de datos es fácil, lo otro no sé hacerlo. Pero no tengo claro que se puedan almacenar ficheros dentro de ese sistema, o cómo funcionaría en distintos sistemas operativos.


• Yo estoy usando ya wikis personales para otras cosas (tengo pendiente escribir sobre eso) y podría adaptar una para esta tarea. Siendo html, son universales. Pero tendría que retocar el código, y los artículos no estarían contenidos dentro sino en una carpeta dedicada a eso; no me parece lo mejor.

Igual tengo suerte y alguien que lea esto conoce alguna manera mejor de hacer lo que quiero. De hecho, si a alguien le interesa el tema, puedo dar más detalles, o incluso escribir aquí la solución con la que me quede al final...